Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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