Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNPHO15079 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNPHO15079 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNPHO15079 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNPHO15079 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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