Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A6NL46 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A6NL46 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A6NL46 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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