Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms