Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRFN1Q9P244 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRFN1Q9P244 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRFN1Q9P244 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRFN1Q9P244 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRFN1Q9P244 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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