Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms