Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGF29Q96ES7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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