Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms