Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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