Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TLR1Q15399 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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TLR1Q15399 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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TLR1Q15399 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TLR1Q15399 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TLR1Q15399 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TLR1Q15399 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TLR1Q15399 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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