Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms