Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms