Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HBBP68871 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HBBP68871 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms