Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRCP23327 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRCP23327 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRCP23327 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms