Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNA2P20248 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms