Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMX2-CTNND1H3BSU7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms