Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms