Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FANCIQ9NVI1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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