Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms