Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms