Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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C9orf135Q5VTT2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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