Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A3Q495N2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A3Q495N2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A3Q495N2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A3Q495N2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A3Q495N2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC36A3Q495N2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC36A3Q495N2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms