Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP13Q15645 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP13Q15645 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms