Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms