Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms