Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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