Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms