Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms