Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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