Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPANXN3Q5MJ09 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms