Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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