Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms