Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms