Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC24A2Q9UI40 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms