Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHACTR1Q9C0D0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms