Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms