Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms