Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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