Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIP10Q15642 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TRIP10Q15642 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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