Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOFQ13790 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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