Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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