Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDH17Q12864 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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