Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EEF1A1P68104 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EEF1A1P68104 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms