Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms