Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms