Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms