Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFP01375 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFP01375 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFP01375 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFP01375 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms