Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms