Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PADI1Q9ULC6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms