Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM55Q9BYV6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms